Рассмотрим ситуацию - есть компьютер с windows (xp sp3) и сервер с linux (CentOS 5.2).
Для управления таким сервером часто используется протокол ssh.
Для этого нам потребуется программа PuTTY.

Все настройки делаем под root.

Для настройки выполняем следующую последовательность действий:

1. На сервере генерим ключ командой ssh-keygen (можно задать пароль для файла ключей)
Ключи будут лежит в /root/.ssh/
id_rsa
id_rsa.pub
Настройки /etc/ssh/sshd_config

2. Правим /etc/ssh/sshd_config.
Точнее смотрим, где лежит файл authorized_keys (обычно /root/.ssh/ authorized_keys).
Можно сделать один файл со всеми ключами всех пользователей и положить его в какую-нибудь папку, а потом тут прописать путь до этого файла.

3. Запускаем демон service sshd start
Если не стартует – исправляем ошибки.

4. Генерим на компе с которого будем админить с помощью PUTTYGEN.EXE (эта программа входит в комплект утилит PuTTY) два файла с ключами:
Public ключевой файл - admin
Private ключевой файл - admin.ppk

5. На компе запускаем PuTTY
Указываем ip адрес сервера и подключаемся к северу, используя логин и пароль.

6. В файл authorized_keys дописываем свой Public ключ в формате:
ssh-rsa AAAAB…..Ws= камент
где AAAAB…..Ws – строка из файла admin

7. Перезапускаем демон service sshd restart (не обязательно – так на всякий случай )

8. Пытаемся подключиться к серверу с помощью PuTTY указав в разделе Connection – SSH – Auth Private key file for authentication = admin.ppk

Если подключается - значит все сделали правильно, если не подключается то ищем ошибку.

PS: Для увеличения безопасности сервера можно запретить подключаться через ssh с помощью пароля, оставив только доступ по ключам.
Для этого в файле /etc/ssh/sshd_config изменяем параметр PasswordAuthentication с yes на no.